《Biotechnol Bioeng》:耐酸性大腸桿菌利用醋酸鹽生產衣康酸
BACKGROUND INTRODUCTION
利用豐富廉價的碳源可以有效降低生產成本,提高經(jīng)濟可行性。其中,醋酸鹽就是一種非常有前途的碳源,通常以較高濃度存在于廢物和生物質的水解產物中。
衣康酸學名為甲叉琥珀酸,亞甲基丁二酸,是不飽和二元有機酸。它含不飽和雙鍵,具有活潑的化學性質,可進行自身間的聚合,也能與其他單體如丙烯腈等聚合;能進行各種加成反應,酯化反應和聚合反應,是化學合成工業(yè)的重要原料,也是化工生產的重要原料,可用作酸味劑、pH調節(jié)劑、金屬螯合劑等。
在2004年,美國能源部將衣康酸評選為12種最具發(fā)展?jié)摿Φ纳镔|來源平臺化合物之一。衣康酸主要通過絲狀真菌土曲霉(Aspergillus terreus)的發(fā)酵產生。然而,由于發(fā)酵過程復雜、菌體生長緩慢、蛋白酶系統(tǒng)復雜、發(fā)酵過程持續(xù)需氧量高、生產成本高、副產物難以控制,以及缺乏有效的基因工程工具等因素,導致土曲霉發(fā)酵生產衣康酸水平受到了限制,40余年里產量都沒有明顯的提升。隨著基因工程、合成生物學及系統(tǒng)生物學的飛速發(fā)展,越來越多的研究者將目光聚焦于其他底盤細胞,將衣康酸合成途徑構建在異源細胞中,如大腸桿菌、酵母細胞和谷氨酸棒狀桿菌等,以期提升工業(yè)衣康酸的產能。
2018年,韓國浦項科技大學(Pohang University of Science and Technology)的Myung Hyun Noh等人,在《Biotechnology and Bioengineering》雜志(IF3.952;工程技術2區(qū))發(fā)表了題為“Production of itaconic acid from acetate by engineering acid-tolerant Escherichia coli W ”的文章。
所用到的主要方法
METHODS
1.HPLC:采用高壓輸液泵將規(guī)定的流動相泵入色譜柱,對供試品進行分離測定的色譜方法。適用于溶解后能制成溶液的樣品,不受樣品揮發(fā)性、熱穩(wěn)定性的限制,用途廣泛。
2.LC-MS:質譜分析是先將物質離子化,按離子的質荷比分離,然后測量各種離子譜峰的強度而實現(xiàn)分析目的的一種分析方法。液質連用實現(xiàn)對復雜混合物更準確的定量和定性分析。而且也簡化了樣品的前處理過程,使樣品分析更簡便。
3.real-time PCR:是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,最后標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。利用熒光信號的變化實時檢測PCR擴增反應中每一個循環(huán)擴增產物量的變化,通過Ct值和標準曲線的分析對起始模板進行定量分析。該技術已經(jīng)被廣泛用于監(jiān)測細胞mRNA表達量的變化;比較不同組織的mRNA表達差異。
4.異檸檬酸裂解酶(isocitrate lyase,ICL)測定:ICL催化異檸檬酸降解為乙醛酸和琥珀酸,乙醛酸和NADH在LDH的作用下生成乙醇和NAD,NADH在340nm 下有特征吸收峰,監(jiān)測340nm吸光度的減小速率可間接反應ICL 活性。
ABSTRACT
利用豐富廉價的碳源可以有效降低生產成本,提高經(jīng)濟可行性。醋酸鹽是一種很有前途的碳源,可以實現(xiàn)經(jīng)濟有效的微生物轉化過程。在這項研究中,作者設計了一種從醋酸鹽生產衣康酸的大腸桿菌菌株。由于已知醋酸鹽抑制細胞的生長,作者首先篩選出具有高度耐受醋酸鹽特性的大腸桿菌菌株,并最終選擇W菌株作為后續(xù)研究所用的宿主。隨后,通過使用合成的啟動子和5'UTR(非翻譯區(qū))來過表達cad基因(編碼順烏頭酸脫羧酶)獲得WC菌株。然而,由于醋酸鹽吸收低,WC菌株僅產生0.13g / L衣康酸。為了改善產量,進一步通過途徑基因的過表達以及其失調來擴增乙酸(即醋酸)同化途徑和乙醛酸分流途徑。所得菌株WCIAG4在用醋酸鹽為唯一碳源發(fā)酵88小時后,可產生3.57g / L衣康酸(理論最大產率的16.1%)。這一研究也表明:醋酸鹽可以成為工程化大腸桿菌生物化學生產的潛在原料。
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