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3D生物打印癌癥模型:從基礎(chǔ)生物學(xué)到藥物開發(fā)

前言

目前,在開發(fā)新藥方面投入的努力往往無(wú)法轉(zhuǎn)化為對(duì)癌癥患者有意義的臨床益處。因此,開發(fā)更有效的抗癌治療方法并準(zhǔn)確預(yù)測(cè)其臨床價(jià)值仍然是迫切的醫(yī)療需求。由于實(shí)體癌具有由不同細(xì)胞類型和細(xì)胞外基質(zhì)組成的復(fù)雜和異質(zhì)結(jié)構(gòu),三維(3D)癌癥模型在促進(jìn)我們對(duì)癌癥生物學(xué)的理解方面具有巨大的潛力。

先進(jìn)的3D生物打印癌癥模型有可能徹底改變我們發(fā)現(xiàn)治療靶點(diǎn)和開發(fā)新藥的方式,并以準(zhǔn)確、可復(fù)制、臨床可轉(zhuǎn)化和穩(wěn)健的方式進(jìn)行個(gè)性化抗癌治療。因此,深入了解2D、3D和腫瘤動(dòng)物模型之間的腫瘤發(fā)生差異至關(guān)重要,這一新興領(lǐng)域?qū)⒂兄谀壳暗陌┌Y研究以及新療法的臨床轉(zhuǎn)化。

3D生物打印癌癥模型的優(yōu)勢(shì)

理想的3D生物打印癌癥模型可以精確地再現(xiàn)特定腫瘤的體內(nèi)環(huán)境,包括其灌注血管。使得能夠模擬體內(nèi)環(huán)境對(duì)腫瘤細(xì)胞行為進(jìn)行多種生化評(píng)估。事實(shí)上,基因表達(dá)分析表明,與2D培養(yǎng)物相比,3D生物打印的癌癥模型可以顯示免疫球蛋白生成、促炎分子表達(dá)、細(xì)胞因子和/或趨化因子的激活、細(xì)胞-細(xì)胞粘附途徑的上調(diào)以及和DNA復(fù)制細(xì)胞分裂相關(guān)蛋白的減少。這些差異提供了3D環(huán)境如何影響癌細(xì)胞生長(zhǎng)、遷移、侵襲、干細(xì)胞和基因表達(dá)的見解。

此外,原始腫瘤ECM的彈性、可塑性和機(jī)械性能可以通過(guò)使用特定的基質(zhì)材料進(jìn)行建模。例如,肝源脫細(xì)胞ECM和乳腺源脫細(xì)胞的ECM具有保留的微結(jié)構(gòu)和超微結(jié)構(gòu),與基質(zhì)中結(jié)合和隔離的生長(zhǎng)因子一起控制細(xì)胞位置和定向。通過(guò)數(shù)字光處理(DLP)技術(shù)打印的去細(xì)胞化ECM支架能夠?qū)崿F(xiàn)精確的空間細(xì)胞沉積,從而保留了這些組織特異性生長(zhǎng)因子;贒LP的模型也被用于研究胰腺導(dǎo)管腺癌發(fā)展的初始階段。

血管在腫瘤增殖、氧擴(kuò)散、血管生成、血管內(nèi)和血管外滲中起著至關(guān)重要的作用。因此,在仿生腫瘤模型中實(shí)現(xiàn)功能性血管網(wǎng)絡(luò)對(duì)于維持細(xì)胞活力和揭示腫瘤與血管之間的密切關(guān)系至關(guān)重要。通過(guò)含有血管系統(tǒng)的3D生物打印癌癥模型可以研究這種動(dòng)態(tài)環(huán)境,包括循環(huán)癌細(xì)胞如何與基質(zhì)細(xì)胞和浸潤(rùn)的免疫細(xì)胞相互作用,不同細(xì)胞類型之間分泌因子的交換,對(duì)外部刺激的反應(yīng),以及癌細(xì)胞對(duì)轉(zhuǎn)移的微環(huán)境的行為適應(yīng)。

每種癌癥都有獨(dú)特的TME,包括各種健康功能細(xì)胞類型,如基質(zhì)細(xì)胞、血管細(xì)胞和免疫細(xì)胞。然而,非生物打印的3D癌癥模型是通過(guò)如水凝膠構(gòu)建物、聚合物支架、微載體珠和懸滴實(shí)現(xiàn)的,不能對(duì)組織形成進(jìn)行時(shí)空控制,也不允許長(zhǎng)期觀察動(dòng)態(tài)變化。3D生物打印模型可以通過(guò)重建整個(gè)TME(包括其功能和結(jié)構(gòu)層次)來(lái)克服這些限制,從而以高分辨率忠實(shí)地模擬復(fù)雜的體內(nèi)腫瘤組織結(jié)構(gòu),并保持患者衍生組織的活力和功能。

3D生物打印癌癥模型的重要作用

模擬轉(zhuǎn)移性生態(tài)位

癌癥研究中的一個(gè)重要挑戰(zhàn)是構(gòu)建能夠重現(xiàn)自然轉(zhuǎn)移生態(tài)位的體外模型。除了不同轉(zhuǎn)移位置之間ECM特性的差異外,侵襲癌細(xì)胞和轉(zhuǎn)移龕內(nèi)TME之間的相互作用在介導(dǎo)轉(zhuǎn)移級(jí)聯(lián)中至關(guān)重要。

在模擬骨轉(zhuǎn)移龕的3D生物打印模型中,MDA-MB-231乳腺癌細(xì)胞與成骨細(xì)胞和人骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞(MSC)共培養(yǎng),以模擬骨TME。在加入癌細(xì)胞后的5天內(nèi),MSCs和成骨細(xì)胞的增殖率降低,表明乳腺癌細(xì)胞在腫瘤骨中誘導(dǎo)骨溶解。此外,該模型中的乳腺癌細(xì)胞顯示促血管生成因子VEGF分泌增加,堿性磷酸酶活性降低,這些是新骨形成的標(biāo)志。

模擬腫瘤血管

提高對(duì)腫瘤細(xì)胞-內(nèi)皮細(xì)胞相互作用的理解可以揭示腫瘤轉(zhuǎn)移和血管生成的重要機(jī)制。通過(guò)3D生物打印技術(shù),生成乳腺癌微球體,其包封含有人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞(HUVEC)的微纖維。當(dāng)與乳腺癌細(xì)胞共同培養(yǎng)時(shí),HUVEC向纖維外的癌細(xì)胞伸長(zhǎng),這些細(xì)胞只保留在纖維內(nèi),并在纖維內(nèi)形成血管樣空腔。這一發(fā)現(xiàn)顯示了共同培養(yǎng)的3D生物打印癌癥模型在重塑癌細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞之間的相互作用方面的潛力。

抗腫瘤免疫

將來(lái)自TME和外周的免疫細(xì)胞帶入3D生物打印模型可以提供一個(gè)可復(fù)制的平臺(tái)來(lái)研究人類抗癌免疫反應(yīng),從而生成適合于理解腫瘤生物學(xué)和藥物測(cè)試的腫瘤模型。例如,在由膀胱癌細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、HUVEC和單核細(xì)胞組成的3D生物打印模型中,用卡介苗(BCG)治療可導(dǎo)致單核細(xì)胞促炎細(xì)胞因子的分泌增加,癌細(xì)胞生長(zhǎng)減少。

目前,已經(jīng)開發(fā)了幾種3D生物打印模型,以快速可靠地評(píng)估免疫調(diào)節(jié)劑和基于細(xì)胞的癌癥免疫療法的療效。例如,3D生物打印模型已用于評(píng)估神經(jīng)母細(xì)胞瘤的嵌合抗原受體(CAR)T細(xì)胞治療。

腦惡性腫瘤在治療上面臨相當(dāng)大的挑戰(zhàn),部分原因是其獨(dú)特的腦TME促進(jìn)腫瘤進(jìn)展;贒LP的3D生物打印膠質(zhì)母細(xì)胞瘤模型已開發(fā)出來(lái),模擬腦TME,包含膠質(zhì)瘤干細(xì)胞、星形膠質(zhì)細(xì)胞、神經(jīng)前體細(xì)胞和巨噬細(xì)胞。該模型還能夠分析巨噬細(xì)胞表型,并檢測(cè)由于癌細(xì)胞與TME相互作用而發(fā)生的多種轉(zhuǎn)錄變化。在這個(gè)模型中,癌細(xì)胞招募的巨噬細(xì)胞獲得了促進(jìn)腫瘤發(fā)生的膠質(zhì)瘤相關(guān)表型。

通過(guò)結(jié)合不同的技術(shù)并調(diào)整所需的組織樣特性和細(xì)胞成分,3D生物打印模型可以作為研究TME和癌癥免疫學(xué)的寶貴工具。

3D生物打印癌癥模型的藥物開發(fā)應(yīng)用

3D生物打印使細(xì)胞和ECM的組裝能夠形成3D構(gòu)建體,該構(gòu)建體重現(xiàn)了癌癥組織的復(fù)雜性,并可作為發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)、抗癌藥物的臨床前測(cè)試和個(gè)性化癌癥治療開發(fā)的穩(wěn)健和可重復(fù)的平臺(tái)。

藥效評(píng)估

3D打印生物癌癥模型已應(yīng)用于多種藥物的篩選和發(fā)現(xiàn)。ECM特性(如密度和組成)影響藥物擴(kuò)散和腫瘤滲透,一些3D生物打印腫瘤模型考慮了這些因素。在一種迭代的3D生物打印方法中,使用了懸浮在明膠-海藻酸鹽-基質(zhì)生物材料中的GP-118患者來(lái)源的胃腺癌細(xì)胞,這種3D生物打印的胃腺癌模型對(duì)多西紫杉醇、5-氟尿嘧啶和順鉑具有化療抗性,可用于評(píng)估開發(fā)藥物的耐藥性。

3D生物打印模型也已被用于評(píng)估單克隆抗體的治療效果。例如metuzumab(一種抗CD174抗體,用于治療多種癌癥),研究人員使用熱敏生物材料對(duì)由SMMC-7721肝癌細(xì)胞和HUVEC組成的微流體進(jìn)行3D生物打印。與2D培養(yǎng)相比,3D模型中需要更高劑量的metuzumab來(lái)抑制癌細(xì)胞遷移和增殖。另外,將人外周血單個(gè)核細(xì)胞納入3D生物打印模型使研究者能夠評(píng)估m(xù)etuzumab誘導(dǎo)的ADCC細(xì)胞毒性,這是治療性抗體的一個(gè)重要方面。

藥物篩選平臺(tái)

除了評(píng)估腫瘤對(duì)藥物的反應(yīng)外,3D生物打印平臺(tái)還可以幫助高通量篩選化合物和批準(zhǔn)用于不同疾病或適應(yīng)癥的藥物。全外顯子組測(cè)序(WES)可以識(shí)別患者癌癥樣品的突變譜,并通過(guò)將這些突變譜與靶向突變的特定藥物進(jìn)行關(guān)聯(lián)來(lái)預(yù)測(cè)藥物敏感性。

靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)

將可灌注血管系統(tǒng)添加到多細(xì)胞3D生物打印模型中可能會(huì)進(jìn)一步改善藥物篩選平臺(tái)。例如,正在開發(fā)的一個(gè)3D生物打印的微工程膠質(zhì)母細(xì)胞瘤模型,該模型包含了內(nèi)襯內(nèi)皮細(xì)胞和周細(xì)胞的可灌注毛細(xì)血管,并連接到周血泵。這種3D模型可以反映出膠質(zhì)母細(xì)胞瘤樣品的異質(zhì)性,與來(lái)自同一細(xì)胞的2D培養(yǎng)物相比,這種3D模型中的腫瘤細(xì)胞在轉(zhuǎn)錄上與體內(nèi)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤腫瘤細(xì)胞更相似。值得注意的是,這個(gè)模型顯示了P-選擇素的上調(diào),而在2D培養(yǎng)基中生長(zhǎng)的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞不表達(dá)P-選擇素,也不受P-選擇蛋白抑制劑的影響,這表明使用3D生物打印癌癥模型可能會(huì)發(fā)現(xiàn)傳統(tǒng)2D培養(yǎng)無(wú)法檢測(cè)到的治療靶點(diǎn)。

總之,3D生物打印癌癥模型已被證明比傳統(tǒng)2D培養(yǎng)方法更能反映腫瘤異質(zhì)性、TME復(fù)雜性、癌細(xì)胞行為、基因表達(dá)特征和藥物反應(yīng)。這些模型還提供了研究癌癥治療方法參數(shù)的平臺(tái),這些參數(shù)無(wú)法使用傳統(tǒng)2D培養(yǎng)方法或簡(jiǎn)單3D模型進(jìn)行充分研究。

臨床試驗(yàn)

各種正在進(jìn)行的臨床試驗(yàn)正在評(píng)估3D癌癥模型在藥物篩選、靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和個(gè)性化治療方面的預(yù)測(cè)能力。例如,一項(xiàng)正在進(jìn)行的臨床試驗(yàn)正在評(píng)估3D生物打印肝癌模型預(yù)測(cè)化療對(duì)結(jié)直腸癌以及結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移的反應(yīng)(NCT04755907)。另一項(xiàng)試驗(yàn)使用了透明質(zhì)酸-明膠生物材料的3D生物打印來(lái)制作骨髓瘤器官樣模型(NCT03890614),旨在建立患者特異性生物印跡模型,以研究骨髓瘤生物學(xué)和化療敏感性。這些臨床研究為使用3D生物打印癌癥模型準(zhǔn)確模擬患者腫瘤及其動(dòng)態(tài)微環(huán)境并預(yù)測(cè)治療結(jié)果的可行性提供了概念證明。

小結(jié)

3D生物打印癌癥模型有可能改變我們研究、診斷、預(yù)防和治療癌癥的方式。這些模型的商業(yè)化,特別是在藥物開發(fā)和測(cè)試方面,預(yù)計(jì)將產(chǎn)生巨大的經(jīng)濟(jì)效益。此外,先進(jìn)的3D生物打印技術(shù),結(jié)合基于機(jī)器學(xué)習(xí)和人工智能的組學(xué)方法,可能發(fā)現(xiàn)癌癥生物學(xué)的基本機(jī)制,揭示新的生物標(biāo)記物和藥物靶點(diǎn),并推動(dòng)有效的個(gè)性化癌癥治療的發(fā)展。

參考文獻(xiàn):

1.3Dbioprinted cancer models: from basic biology to drug development. Nat RevCancer.2022 Oct 24.

       原文標(biāo)題 : 3D生物打印癌癥模型:從基礎(chǔ)生物學(xué)到藥物開發(fā)

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