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華為云助力新冠病毒基因自動化鑒定云平臺上線

2020-02-12 17:30

2月10日，由中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所、中國科學院上海巴斯德研究所共同開發(fā)，由華為云提供技術支撐的新冠病毒基因組自動化鑒定平臺（Virus Identification Cloud, VIC）正式上線，將推動疫情的診治與防控，大幅提高診斷效率。

如何精準高效地診斷病人是否感染新型冠狀病毒，是當前防控工作的關鍵問題。國家衛(wèi)健委發(fā)布的《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案（試行第五版）》，對鑒別診斷要求，“單從臨床表現(xiàn)、胸部影像學難以鑒別，需依靠病原學檢測來區(qū)分�！�

基因組測序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學證據(jù)之一，是病毒朔源、變異進化、致病機理等研究的基礎性工作，在疫情防控、疾病診治、藥物篩選、疫苗設計等工作中也發(fā)揮著不可替代的基礎性的作用，與國家衛(wèi)健委要求高度契合。

圖：病毒采樣與分析流程

VIC平臺直接對接二代基因測序原始數(shù)據(jù)，具有對數(shù)據(jù)全自動質量控制、拼接和病毒組成分析等功能，實現(xiàn)了快速檢測樣本中可能存在的包括新型冠狀病毒在內的各種病毒，并在線分析其相對載量，基于分析結果，精準識別病毒基因特性，監(jiān)測病毒變異趨勢，為后續(xù)的疫苗與藥物研發(fā)提供數(shù)據(jù)支撐。

VIC平臺實現(xiàn)了從病毒組基因組測序到基因組拼接與鑒定的“一鍵式”自動化服務，極大簡化了操作流程。各醫(yī)院只需上傳病例原始數(shù)據(jù)至云端，即可觸發(fā)自動化的病毒基因分析流程，并獲得該病例的全基因組分析結果。

華為云容器為VIC平臺提供了自動化測序分析引擎和強大的算力，支持高通量多樣本云端并行分析。分析結果不僅能為全面分析研究患者的呼吸道病毒組、研究其致病因子提供支撐，還可以幫助醫(yī)院進行臨床診斷，為采用相應的治療措施提供參考，同時還可監(jiān)測病毒變異趨勢，便于醫(yī)院各界提前做出應對措施。