多組學分析確定分子定義的阿爾茨海默病亞型
研究人員使用機器學習方法,整合了高通量的轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、代謝組學和脂質(zhì)組學特征,為阿爾茨海默病(AD)提供了新的關(guān)鍵分子見解。
貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心
6月12日消息
組學分析是對大數(shù)據(jù)集進行分析,以提取生物分子(基因、DNA、RNA、蛋白質(zhì)、代謝物等)的有意義信息的過程,其目標是闡明典型的分子通路,并破譯疾病中出錯的地方。
在一項由人類遺傳學家、貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心(Beth Israel Deaconess Medical Center, BIDMC)神經(jīng)內(nèi)科神經(jīng)生物樣本庫主任、醫(yī)學博士 Bruno A. Benitez 領(lǐng)導的研究中,研究人員使用機器學習方法,整合了高通量的轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、代謝組學和脂質(zhì)組學特征,為阿爾茨海默病(AD)提供了新的關(guān)鍵分子見解,這是單一組學分析無法提供的。這篇論文發(fā)表在《公共科學圖書館:生物學》(PLOS Biology)雜志上。
研究于2024年4月30日發(fā)表在《PLOS Biology》(最新影響因子:9.8)雜志上
跨組學方法確定了四種不同的 AD 分子特征,其中一種與較差的認知功能和神經(jīng)病理學特征相關(guān),包括死亡時顯著較高的臨床失智癥評分,癥狀發(fā)作后較短的壽命,較嚴重的神經(jīng)變性和神經(jīng)炎癥,以及較低的代謝組學水平。
這一分子特征存在于與更晚期疾病相關(guān)的多個受累皮質(zhì)區(qū)域,即在 AD 中觀察到更多的 tau 蛋白病理學,以及在 AD 早期和晚期改變的突觸相關(guān)基因和信號通路的顯著失調(diào)。
該團隊的結(jié)果表明,跨組學分析可以捕獲差異,并識別復雜和異質(zhì)性疾病(如阿爾茨海默。的分子變異,否則在單模態(tài)組學方法中會被遺漏。利用這種方法,科學家可以更好地了解這種疾病和其他疾病,并為新的突破和潛在的治療鋪平道路。
Benitez 說,跨組學方法可以作為研究人員努力了解阿爾茨海默病的有力工具。他補充說:“這些方法不僅優(yōu)于單一組學分析,而且為這種疾病的發(fā)病機制提供了寶貴的分子見解!
Benitez 說:“我們已經(jīng)確定了反映突觸功能障礙、認知和 AD 分期的疾病早期階段的分子標志物,為精準醫(yī)學鋪平了道路。我們的研究作為 AD 患者的希望燈塔,激勵我們繼續(xù)不懈地追求知識和進步,我們希望在患阿爾茨海默病的 BIDMC 患者中重復這些發(fā)現(xiàn)!
貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心是哈佛醫(yī)學院主要的教學醫(yī)院。它的前身是“貝斯以色列醫(yī)院”(1916年成立)和“新英格蘭女執(zhí)事醫(yī)院”(1896年成立),1996年2所醫(yī)院合并
參考文獻
Source:Beth Israel Deaconess Medical Center
In Brief: Multi-omics Analysis Identifies molecularly defined Alzheimer’s disease subtypes
Reference:
Abdallah M. Eteleeb et al, Brain high-throughput multi-omics data reveal molecular heterogeneity in Alzheimer's disease, PLOS Biology (2024). DOI: 10.1371/journal.pbio.3002607
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原文標題 : 多組學分析確定分子定義的阿爾茨海默病亞型
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