NEC日前發(fā)布了采用AI預(yù)測(cè)技術(shù)的基因分析結(jié)果，用于設(shè)計(jì)可促進(jìn)全球多數(shù)人群T細(xì)胞反應(yīng)（注1）的SARS-CoV-2（新型冠狀病毒）疫苗。本成果旨在幫助防止新型冠狀病毒感染癥“COVID-19”感染擴(kuò)大，并支援全球疫苗開(kāi)發(fā)，由NEC OncoImmunity AS（注2）與NEC歐洲研究所合作成立的研究團(tuán)隊(duì)所取得。本研究應(yīng)用了NEC與NEC OncoImmunity在個(gè)體化癌癥疫苗開(kāi)發(fā)中使用的AI預(yù)測(cè)技術(shù)。

論文網(wǎng)站“bioRxiv”上發(fā)表的研究結(jié)果顯示，分析數(shù)千種SARS－CoV－2的基因組序列，鎖定了全球人群中最經(jīng)常被找到的100個(gè)HLA等位基因（多種免疫型）的表位（可作為疫苗靶點(diǎn)）。

具體來(lái)說(shuō)，不僅使用預(yù)測(cè)算法分析了作為冠狀病毒名稱起源的表面刺突蛋白，還分析了SARS-CoV-2的全部蛋白，根據(jù)所得數(shù)據(jù)，對(duì)多個(gè)HLA等位基因型鎖定“熱點(diǎn)（Hot Spot）”，該“熱點(diǎn)”重復(fù)包含了SARS－CoV－2蛋白中的共通表位。另外，充分采用本算法，優(yōu)先選定了全球人群覆蓋最廣、且病毒蛋白中變異較少、今后也很難發(fā)生變異的保存區(qū)域中獲得的最佳熱點(diǎn)組。并且，為確保安全性，除去了病毒表位中與人類蛋白相似度高、特別是在重要臟器中發(fā)現(xiàn)的熱點(diǎn)。

本成果的分析結(jié)果展示了對(duì)世界多數(shù)人群安全有效、且亦能應(yīng)對(duì)現(xiàn)在和將來(lái)的病毒多樣性的疫苗設(shè)計(jì)，同時(shí)也體現(xiàn)了NEC集團(tuán)AI預(yù)測(cè)技術(shù)的技術(shù)水平高度。

在公開(kāi)本次研究成果、支援科學(xué)進(jìn)步的同時(shí)，NEC將開(kāi)啟以加快疫苗開(kāi)發(fā)為目的的合作活動(dòng)。

NEC常務(wù)執(zhí)行董事兼首席技術(shù)官西原基夫表示：“很高興NEC的AI技術(shù)能夠?yàn)楫?dāng)今世界面臨的嚴(yán)重問(wèn)題做出貢獻(xiàn)。在世界各國(guó)都在為解決這一艱難課題而努力的情況下，NEC作為企業(yè)公民也有責(zé)任和義務(wù)參與到這一行動(dòng)中。我們將以此次研究為開(kāi)端，最大限度地活用AI技術(shù)這一NEC集團(tuán)的優(yōu)勢(shì)，與各種各樣的企業(yè)和機(jī)構(gòu)合作，抑制新型冠狀病毒感染癥的擴(kuò)大，為了讓全球的人們能夠盡早恢復(fù)日常生活而努力。”

NEC OncoImmunity的首席科學(xué)家Trevor Clancy博士表示：“敝公司首席執(zhí)行官Richard Stratford博士和其團(tuán)隊(duì)以及NEC集團(tuán)，對(duì)于我們針對(duì)個(gè)體化癌癥免疫療法的機(jī)器學(xué)習(xí)軟件‘NEC Immune Profiler’從現(xiàn)在投入的癌癥領(lǐng)域迅速適應(yīng)感染癥領(lǐng)域，并能夠?yàn)樾滦凸跔畈《靖腥景Y的應(yīng)對(duì)提供支持，感到非常振奮。我們的AI和生物信息平臺(tái)，不僅可以守護(hù)全球人類，而且對(duì)于現(xiàn)在和將來(lái)可能發(fā)生的新型冠狀病毒的多種變異版本，還能夠設(shè)計(jì)出可引發(fā)以長(zhǎng)期記憶免疫反應(yīng)等廣泛免疫反應(yīng)的疫苗，這是一種很大的鼓勵(lì)�！�

NEC歐州研究所數(shù)據(jù)科學(xué)與系統(tǒng)平臺(tái)部門總經(jīng)理Saverio Niccolini博士表示：“我們?cè)�本是為預(yù)測(cè)各個(gè)癌癥患者的免疫反應(yīng)而設(shè)計(jì)的算法，應(yīng)用到了大規(guī)模的感染癥群體。我們算法中的計(jì)算機(jī)驗(yàn)證（in silico驗(yàn)證）考慮到了人類在整個(gè)大陸的遺傳背景。目前，全球正受到日益擴(kuò)大的新型冠狀病毒感染癥的威脅，我們的成果顯示了為阻止這一威脅的全球舉措做出貢獻(xiàn)的可能性，這是非常重要的。我們已開(kāi)始與合作伙伴就wet-lab實(shí)驗(yàn)進(jìn)行協(xié)商，正在為開(kāi)發(fā)出對(duì)全球多數(shù)人群有效的疫苗而邁出重要的一步。”

論文信息

標(biāo)題：

Artificial intelligence predicts the immunogenic landscape of SARS－CoV－2： toward universal blueprints for vaccine designs

作者：

Brandon Malone， Boris Simovski， Clément Moliné， Jun Cheng， Marius Gheorghe， Hugues Fontenelle， Ioannis Vardaxis， Simen Tenn?e， Jenny－Ann Malmberg， Richard Stratford， Trevor Clancy

（注1）T細(xì)胞反應(yīng)：T細(xì)胞是白血球中的一種免疫細(xì)胞，激活T細(xì)胞的反應(yīng)為T細(xì)胞反應(yīng)。

（注2）總部：挪威奧斯陸、CEO：Richard Stratford。